בשנת 1960, בחוק מקרקעי ישראל, התש"ך-1960, נקבע כי שר האוצר ושר החקלאות יהיו ממונים על ביצועו במשותף.
בשנת 1990 החליטה הממשלה, כחלק מן ההיערכות לקליטת העלייה, על מינוי שר השיכון כיושב ראש מועצת מקרקעי ישראל וכסמכות המבצעת את חוק מינהל מקרקעי ישראל.
ביוני 1996 התקבלה החלטת ממשלה למנות את שר התשתיות הלאומיות, אריאל שרון, ליושב ראש מועצת מקרקעי ישראל ולשר הממונה על ביצוע חוק מקרקעי ישראל.
בספטמבר 2002 התקבלה החלטה למנות את ראש הממשלה, אריאל שרון, ליושב ראש מועצת מקרקעי ישראל ולשר הממונה על ביצוע חוק מקרקעי ישראל.
במרץ 2003 התקבלה החלטה למנות את שר התמ"ס, אהוד אולמרט, ליושב ראש מועצת מקרקעי ישראל ולשר הממונה על ביצוע חוק מקרקעי ישראל.
ביולי 2007 התקבלה החלטה למנות את שר הבינוי והשיכון מר זאב בוים ליושב ראש מועצת מקרקעי ישראל ולשר הממונה על ביצוע חוק מקרקעי ישראל.
בשנת 2009 התקבל בכנסת החוק החוק המאשר את הרפורמה במקרקעי ישראל והפיכת מינהל מקרקעי ישראל לרשות ממשלתית. במרץ 2013 הוקמה בפועל רשות מקרקעי ישראל, והחלה רפורמה ארגונית מקיפה.